東京から稚内、関西空港から稚内へは２路線とも１日１便の運行となっています。新千歳空港から稚内へは、ジェット便で、札幌丘珠空港からも運行しております。稚内から利尻、礼文は２００３年より廃止しました千歳等からの直便が有るそうです。
離着陸の時間は割愛させて下さい。 （稚内空港事務所 時刻表）
| 区間 | 機種 | 期間 | 時間 | 備考 |
|---|---|---|---|---|
| 稚内〜東京（羽田） |
エアバスA320型166人乗 ボーイングB767型２８８人乗（繁忙期） | 通年運行 | 約１時間４５分 | ＡＮＡ |
| ボーイングB767型２８８人乗 | ６月〜９月まで1便運航 | 約１時間４５分 | ||
| 稚内〜関西 | ボーイングB737型機１２６人乗 | ６月〜９月まで1便運航 | 約２時間１０分 | ＡＮＡ |
| 稚内〜名古屋（中部） | エアバスA320型１６６人乗 | ６月〜８月まで1便運航 | 約２時間 | ＡＮＫ |
| 稚内〜新千歳 | エアバスA320型１６６人乗 | ６月〜９月まで1便運航 | 約６０分 | ＡＮＡ/ＡＮＫ |
| ボンバルディアDHC8型 56人乗 | 通年運行 | 約１時間 | ||
| 稚内〜丘珠 | ボンバルディアDHC8型 56人乗 | 通年運行 | 約１時間 | Ａ-net |
＊稚内空港〜稚内市内→タクシー約２０分・約３，０００円、バス約２０分・５６０円